Avtor/Urednik		Godnič, Irena; Zorc, Minja; Jevšinek-Skok, Daša; Horvat, Simon; Dovč, Peter; Kovač, Milena; Kunej, Tanja
Naslov		Genetska variabilnost genov za mikro RNA pri govedu
Tip		članek
Vir		In: Potočnik U, Ramšak A, editors. 2. kolokvij iz genetike; 2011 sep 16; Piran. Piran: Slovensko genetsko društvo,
Leto izdaje		2011
Obseg		str. 34-42
Jezik		slo
Izvleček		Mikro RNA (miRNA) spadajo med nekodirajoče RNA s pomembno vlogo v potranskripcijskem uravnavanju tarčnih genov. Za uravnavanje je ključna komplementarnost med tarčno mRNA in območjem na miRNA odgovornim za njuno prepoznavanje in vezavo, imenovanim območje seed. V predhodnih študijah so dokazali, da genetska variabilnost genov za miRNA (miR-SNP) vpliva na fenotipsko raznolikost ter dovzetnost za bolezni pri človeku in miši. Polimorfizmi v genih za miRNA predstavljajo potencial za razvoj bioznačevalcev za fenotipske lastnosti tudi v živinoreji. V ta namen smo razvili prosto dostopno bioinformacijsko orodje za identifikacijo polimorfizmov v genih za miRNA. Z razvitim orodjem smo identificirali 18 SNP-jev, ki se nahajajo v zapisih za pre-miRNA pri govedu. Zbrani polimorfizmi predhodno še niso bili opisani v povezavi z miRNA, prav tako v podatkovnih zbirkah še ni znan njihov status validacije. Ugotovili smo, da je gostota SNP-jev največja v območju seed, kar je v nasprotju s predpostavko o močni evolucijski ohranjenosti tega območja. Validirali smo tri SNP-je v primarnem zapisu gena za miRNA bta-mir-2313 pri govedu. Razvito bioinformacijsko orodje je raziskovalcem lahko v pomoč pri načrtovanju novih projektov za proučevanje vpliva genetske variabilnosti genov za miRNA na fenotipske lastnosti pri govedu.