Avtor/Urednik | Smole-Možina, Sonja; Rozman, Damjana; Raspor, Peter | |
Naslov | Molecular markers of Schwanniomyces (Debaryomyces) YEAST | |
Prevedeni naslov | Molekularni markerji Schwanniomyces (Debaryomyces) kvasovk | |
Tip | članek | |
Vir | Zb Bioteh Fak Univ Ljublj - Kmetijstvo 1990 | |
Vol. in št. | Letnik 65 | |
Leto izdaje | 1995 | |
Obseg | str. 73-80 | |
Jezik | eng | |
Abstrakt | Two molecular genetic methods (karyotyping i.e. separation of intact chromosomes with pulsed field gel electrophoresis-CHEF PFGE and AP-PCR, i.e. PCR fingerprinting with randomly chosen oligonucleotide primers) have been tested for intra- and interspecific differentation of some Schwanniomyces and closely related yeast strains. Because of the large chromosomes (1000-2500 kb), which require prolonged electrophoretic separation protocols, AP-PCR fingerprinting revealed to be more effective for quick differentiation between Schwanniomyces yeast strains, but greater number of primers (deca-mer oligonucleotides with 50-80% G+C, microsatelite repeat sequences) should be tested for generation of strain specific and species specific RAPD markers. The result are discussed also in terms of classification sysstem of Schwanniomyces yeasts. | |
Izvleček | Molekularno-genetska karakterizacija Schwanniomyces in nekaterih sorodnih kvasovk je bila opravljena na osnovi ločbe kromosomov s pulzno elektroforezo (CHEF-PFGE) in z verižno polimerazno reakcijo z uporabo naključno izbranih začetnih zaporedij (AP-PCR). Genotipizacija na osnovi PCR tehnologije je primernejša za hitro ločevanje Schwanniomyces in sorodnih kvasovk za sintezo specifičnih RAPD markerjev pa je potrebna uporaba večjega števila začetnih zaporedij (primerjev), kot so 10/merni oligonukleotidi s 50-80% vsebnostjo G+C ali mikrosatelitskih ponavljajočih se zaporedij. Rezultati so ovrednoteni glede na obstoječo sistematiko Schwanniomyces kvasovk | |
Deskriptorji | YEASTS KARYOTYPING POLYMERASE CHAIN REACTION ELECTROPHORESIS, GEL, PULSED-FIELD DNA PRIMERS MICROSATELLITE REPEATS |