Author/Editor		Renčelj, Andrej; Kunej, Tanja; Razpet, Andrej; Jevšinek-Skok, Daša; Dovč, Peter; Žgur, Silvester; Petrič, Nežika; Planinc, Martina; Malovrh, Špela; Kovač, Milena; Horvat, Simon
Title		Asociacijska analiza haplotipov v genu FTO z lastnostmi zamaščevanja pri govedu (Bos taurus)
Translated title		Association analysis of the FTO gene haplotypes with fat depositon traits in cattle (Bos taurus)
Type		članek
Source		In: Potočnik U, editor. 9. kolokvij iz genetike; 2010 sep 22; Ljubljana. Ljubljana: Slovensko genetsko društvo,
Publication year		2010
Volume		str. 22-7
Language		slo
Summary		Genetske variante pri nedavno odkritem genu FTO imajo dokazan vpliv na debelost pri človeku ter na nalaganje maščevja pri modelnih organizmih ter prašičih. Namen raziskave je bil identificirati polimorfizme posameznih nukleotidov (ang. single nucleotide polymorphism, SNP) pri slovenskem lisastem govedu ter analizirali povezanost med posameznim SNP ter lastnostmi zamaščevanja. Poskusna populacija je bila odbrana iz nacionalnega progenega testa bikov lisaste pasme (171 polbratov ter 31 očetov). S podatkovnimi zbirkami ENSEMBL in NCBI smo pridobili informacije o že znanih SNP v genu FTO pri govedu, medtem ko smo s sekvenciranjem odbranega niza očetov poiskali nove polimorfizme v naši poskusni populaciji. Identificirali smo skupno 23 SNP označevalcev v genu FTO, od tega smo genotipizirali 12 najbolj informativnih. Statistična analiza je potrdila hipotezo, da gen FTO vpliva na lastnosti zamaščevanja - SNP rs41636320 A>T, ki se nahaja v intronu 6, je bil statistično značilno povezan z deležem loja (P>0,0127). V 3' UTR področju gena FTO smo našli potencialno vezavno mesto za miRNA, ki je ohranjeno pri šestih živalskih vrstah. Identificiran SNP povezan z lastnostmi zamaščevanja je lahko podlaga za razvoj novih genetskih označevalcev v genu FTO, ki bi jih uporabljali v rejskem programu in s tem bolj učinkovito izvajali selekcijo na manj zamaščene živali.