Author/Editor     Cirnski, Katarina; Juvan, Peter; Košir, Rok; Rozman, Damjana; Horvat, Simon
Title     Identifikacija kandidatnih genov za kvantitativna lokusa Fob3b1 in Fob3b2 debelosti z uporabo kongenih mišjih linij in ekspresijskih mikromrež
Type     članek
Source     In: Potočnik U, editor. 9. kolokvij iz genetike; 2010 sep 22; Ljubljana. Ljubljana: Slovensko genetsko društvo,
Publication year     2010
Volume     str. 102-9
Language     slo
Summary     Debelost predstavlja v razvitem svetu vedno večji zdravstveni problem in vodi v razvoj številnih kardiovaskularnih obolenj, povišanega krvnega tlaka in nekaterih oblik raka. Ker z monogenimi oblikami debelosti lahko razložimo le majhen del variabilnosti za to lastnost, so v zadnjem času postali bolj informativni poligeni živalski modeli. Pri teh modelih najprej določimo lokacije kvantitativnih lokusov (angl. Quantitative trait loci, QTL) in kasneje razvijemo takoimenovane kongene linije, kjer lahko proučujemo vpliv samo enega tarčnega segmenta. Fob3b ja QTL na mišjem kromosomu 15, ki se je v predhodnih analizah izkazal za izredno pomebnega pri regulaciji nalaganja telesne maščobe. Namen naše raziskave je bil identificirati pozicijske kandidatne gene pri Fob3b kongeni liniji s preučevanjem transkriptoma tkiv, ki so vključena v regulacijo telesne mase ter nalaganje maščevja in apetita (jetra, možgani in gonadalna maščoba). Analiza transkriptoma je pokazala, da se je največ genov diferencialno izražalo v jetrih, nekaj v maščobnem tkivu in nobeden v možganih. Diferencialno izraženi geni so tkivno specifični, kar poemni, da se nek gen ni diferencialno izražal v dveh tkivih hkrati. Vsi diferencialno izdraženi geni so vključeni v z debelostjo povezane procese, kot so metabolizem steroidnih hormonov, maščobnih kislin, PPAR in Wnt signalno pot. Naša raziskava je omogočila, da smo bistveno skrčili listo potencialnih kandidatnih genov odgovornih za fenotipski učinek QTLov Fob3b1 and Fob3b2. identifikacija novih genov za debelost je nujna za boljše razumevanje genetskeosnove debelosti in razvoj preventivnih in kurativnih postopkov za debelost pri človeku in pri domačih živalih.